非法变异人与士兵的激战愈演愈烈，无辜的百姓被攻击波及到，在睡梦中遭遇不测。
单云手下大部分的兵力都被困在前部分的方舟之中，过来还需要一段时间，而对方的人马正从四面八方汇集而来。
无奈之下，单云不得不将刚睡着的人们再次唤醒，让他们自己寻找位置躲避。同时，她将指挥舱交由谢雨负责，自己则带上一队人马去剿灭这帮歹徒。
哪知这群非法变异人早有预谋，他们不仅遍布在各个舱内，还伪装成良民对单云一行人进行偷袭。
双打斗的过程中，这群非法变异人甚至抓住毫无缚鸡之力的良民作为人质，其中就包括余颢的父母——庄女士和余先生。
最终，双方在一处相对宽敞的舱室内形成了对峙局面。
“单云，不想他们死就把指挥权交给我们。”这群非法变异人的头目拿着抢过来的激光枪抵着庄女士的脑袋说道。
单云佯装不在意，冷哼一声：“指挥权交给你们？这与送死有什么区别？”
头目恶毒地笑道：“只要你和你的兵归顺于我，我自然会放你们一马。至于这些百姓，他们活着就是浪费资源。”
“哦，是吗？”单云的身影倏地消失，下一秒已夺过头目手中的枪，一拳将他重重击倒在地。
随后，她一把将庄女士推向士兵那边，同时一脚狠狠踩在了头目的胸口，只听咔嚓几声，后者几根肋骨应声而断。
“在我看来，你们这些人活着才是浪费资源。”
头目挥动双拳，猛攻向单云的双脚。在单云撤脚避开之际，他趁机翻身站起，揉着正在逐渐恢复的肋骨，恶狠狠地说道：“你这是敬酒不吃吃罚酒，那就别怪我只能送你们上路了！”
双方大战再次爆发，各种残影激战到一起。
单云一方人少精锐，头目一方人数占优，一时打得难分难解。
这不是普通人能够参与的战斗，余先生和其他被挟持的百姓被单云趁乱踢向庄女士那边。在一名年轻士兵的催促和保护下，他们向方舟后方逃去。
逃难途中，年轻士兵被伪装成良民的非法变异人举刀偷袭，不幸身首异处。
“砰。”余先生及时拿出儿子给的枪，将这个非法变异人爆头。与此同时，庄女士捡起年轻士兵的头颅安装回他的脖子处。
年轻士兵体内拥有路研发的最新版超级因子，它们积极发挥作用，使头颅重新长回他的脖子上。
而那个被爆头的非法变异人就没有这么幸运了，他体内的超级因子无法治愈特殊子弹造成的致命伤。
危险暂时解决，余先生和庄女士回头瞥了眼。
中部的战斗不容乐观，现有的士兵们为了保护方舟设备及四处乱窜的百姓，作战时打得束手束脚。反观非法变异人，他们深知不赢则死，故越战越勇。
余先生和庄女士当即放弃逃跑，余先生拿起枪负责偷袭追赶百姓的非法变异人，而庄女士则协助百姓们集中撤退。在他们的努力下，竟然也挽救了不少生命。
在众人看不到的地方，方舟后部分的非法变异人已经悄悄集结完成。他们分成两批队伍，一批队伍攻向方舟上方的指挥室，另一批队伍则向中间战场赶来。
庄女士和年轻士兵听到远处传来敌对援军的脚步声，马上停下撤退的步伐，带着百姓们躲避到一处仓库中。
余先生留到最后，他深深看了眼庄女士，随后对众人说道：“你们在这里不要出声。”
他顿了下，狠心地忽略了已经双眼泛红的庄女士，接着说道：“我去通知单指挥长。”
言罢，他将仓库的门锁死后毅然向中部战场跑去。
体质加强过的余先生跑得不慢，不一会就赶到中部战场。
这里刀光剑影，余先生分不清单云在哪里，只得躲到一处墙壁后面大叫道：“单指挥长！你们要小心！敌人的后援军来了！”
“知道了。”单云一脚踢开头目，反手一枪黏液将攻向余先生的非法变异人困住，“你先找地方躲起来！”
“好。”余先生正准备向两侧逃跑，却被迎面而来的另一波非法变异人援军堵住去路。
头目2号走上前两步： “你想逃哪里去？区区一个凡人，凭你也敢与我们作对！”
伴随着“桀桀”的邪笑声，他化为残影攻向余先生。
余先生反应灵敏，还未等他说完便抬枪射击。
子弹擦着头目2号的脸皮而过，没入后方小弟的脑门。
听到后方传来脑袋爆裂开的巨响，头目2号停下脚步，抹掉脸上的擦伤，表情变得阴狠起来。
这时，方舟后方的非法变异人援军也赶到，他们人数众多，将单云一群人彻底围住。
余先生的退路被封死，他的表情变得更加坚毅，手指紧紧扣住扳机。
“凡人，你的武器不赖，但这救不了你！”
头目2号见状，狂妄地大笑起来，和他的手下们像猛兽一般伸出锋利的爪子，企图将身为凡人的余先生撕扯得粉身碎骨！
单云分身乏力，她不得不掏出口袋里的雷光枪……她承诺于宁和余颢要将他们的父母保护好，她会不惜一切代价做到，哪怕背负罪名。
忽然，一道身影将余先生从险境中救出，另一道身影则将余先生面前的歹徒们击退，而第三道身影则从敌方后方出现将包围圈破开一道口子。
“儿子！”余先生惊呼，救下他的是路，面对歹徒的是余颢。
余颢对余先生点了下头，随后展开一紫一红的双刀，攻向敌人的头部……
“你们怎么来了？”单云又惊又喜，瞬移到莉莉丝身边，与她并肩作战，共同抵御敌人。
莉莉丝边战边抽空解释了下情况。
原来，由于超强地震导致了地形发生翻天覆地的变化，寻找位置分散开的生命方舟花了于宁等人不少时间。
龙国除了掉进黑洞的一艘，其他散落各处的生命方舟在灾难之下遇到了不同的困境。于是，他们决定兵分几路前来援助。
在玉清的感应和玉嶂的指挥下，余颢、莉莉丝、路一组负责大洋南部片区；于宁、诺兰、玉嶂一组负责大洋东部片区；其余道者负责西部片区；而御兽者则负责距离最远的北部区域。
他们决定乘坐巨兽一路飞行，沿途被投送到问题最严重的方舟上方。
由于单云处于南部地区，距离他们较近，莉莉丝三人组最先投下来，而其他人则继续朝着东部情况不佳的方舟赶去。
谢雨发现三人后，立刻打开了缓冲舱的舱门。他们一进生命方舟，就见到许许多多尸体和受伤的百姓。还好他们来得及时，不然余先生在劫难逃……
思及此，余颢下手更加狠辣无情……