军队的改革不可能一蹴而就，大量的时间消耗在整编换防上，因为扩编的人数达到了一倍，也为了保障军队的战斗力不至于因为扩编下降。
扩编的军队都是采用一分为二的办法，然后再从有作战经验的民兵中招募，这样既保证了军队的战斗力不会下降的厉害，又能保证新兵的素质，很快的适应战场的需要。
大规模调动军队，在古代不仅是一门艺术，而且隐藏着巨大的风险，尤其是在辽东半岛战事刚刚平息之时，契丹痕德廑可汗因为惨败、舍利王子被俘恼羞成怒，谁也不知道契丹会不会在这个时候对辽东半岛发动新一轮进攻。
安市州的军队能不能就不动，其他地方的军队能少动就少动，本着动静越小越好的原则，军队的换防减到最小，招募的新兵也都是当地的民兵。取消新兵入伍之前，都要到新兵训练营进行训练的规定，同时团以上的军官也都在原来军队中提拔，没有采用本地提拔，异地当官的办法，就是为了尽快的稳定辽东半岛目前的紧张形势。
与军队改革同时进行的还有辽东半岛行政改革，改革的重点有两个方面，一是辽东半岛的行政区域的重新划分，二是王府内部的官僚架构建立。这两点中，建立王府官僚架构看似容易，实则难度最大，利益也最难平衡，需要顾及到方方面面的诉求。
相对而言，重新划分行政管辖区域，看似工作难度最大，但是因为不会涉及到太多人的利益，处理起来反而显得容易推行。
对于新的行政区域划分，李烨征求了许多人的意见，有人认为应该将相邻的县镇合并为州，也有人认为应该以地理界线为标准划分州县，更有人认为应该以经济和人口作为标准划分州县，虽然意见众多，但是表现出来的热情却是不高，反而对划分后的刺史和县令提出了不少建议。
李烨知道这是周围人在等着分享权力的果实，不管这么说，他们的意见终归是意见，是否采纳还取决于李烨自己。
很快，李烨就公布了一份行政区域划分计划：设立连州、行州、青川州、平壤州、安市州、夷洲六州。
连州治所设在大连城，下辖：都里县、长海县、卑沙城、积利城、石城和复县，都里县是以前的都里镇，长海县是以前的六岛十二寨，积利州也被拆分变成了积利县，复县是以前的复州镇，因为地广人稀可以作为以后的移民点。
行州治所设在大连城，下辖：泊汋城、孤山城、鸭绿县和井口县，鸭绿县和井口县为新设县衙，主要为了方便行州的管理。
清川州治所设在清川江城，下辖：平城、新安县，是辽东半岛最重要的粮食产地之一。
安市州治所设在安市城，下辖南楼县、营口县、建安城和瓦口县，营口县在安市城以西八十里处，当年隋唐远征高句丽的时候就已经存在，后来渐渐的废弃了，重建营口县的主要目的是为了防御契丹。
夷洲治所设在沙鹿县，下辖淡水县和澎湖列岛，其他的地方还在开发中，以后夷洲会成为辽东半岛面积最大、管辖范围最广的州县。
平壤州治所设在平壤城，下辖：大同江城和顺安县，同时兼管济州岛、东泽岛、佐渡岛和五岛列岛。
五岛列岛是严力前往倭国时发现的，当时严力还以为自己已经到了倭国，上岛一看只发现了几百个土人，哪有什么倭人的影子。按照李烨的一贯政策，只要发现无人岛屿，便在岛上竖碑，宣称李烨的主权和统治。如今岛上虽然还没有人居住，但是却已经在李烨的统治之下，自然要将五岛列岛划为自己的管辖范围之内。
说起五岛列岛，就不得不说到明朝的统治，明朝大概是中国历史上最糟糕的朝代（它糟糕统治的恶劣后果至今还影响着今天我们这一代中国人）。这位卑贱和尚出身的皇帝，感到他天下得来不易，以一种极其阴暗、保守、封闭、偏狭的心理来保住他的天下，大杀开国功臣、用朱熹的道学来钳制人们的思想，重农轻商，特别是实施严格的海禁，使蓬勃发展的海运和海外贸易受到致命的打击。海禁不仅影响了数万海商的生意，由于这些海商几代人都从事航海在陆地上没有寸土根底，海禁甚至断绝了海商的生计。
王直是当时最著名的一个海上贸易巨头、船主，他早年在广东一带做海上贸易发了大财。明嘉靖十九年（1540年）起以舟山群岛的双屿岛为基地进行海上贸易，拥有一支庞大的船队。
双屿岛那时热闹极了，曾被历史学家称为“十六世纪的上海”。但针对海上贸易的蓬勃发展，明朝进一步收紧海禁，横屿岛被官兵扫荡一空。这个王直还是很有谋略的，他居然率部占领了日本九州西南端的由福江、岩松、九贺、奈留、中通等岛组成的五岛列岛自封为“徽王”（日本典籍中称为“五峰船王”），周围三十六个岛都在他管辖下。日本文献中，对这事也有记载。称王直为“五峰船主”。
王直虽然在五岛列岛建立了一个小独立王国。但他仍上书明朝官府，愿意接受朝廷招安。条件只是开放海禁、允许对外通商贸易，他本人只要求当一个管理贸易的小官。但是昏庸愚蠢的明朝朝廷拒绝了这一建议，明朝廷认定，海禁是明太祖定下的既定方针，决不能改变，按今天习惯的说法坚持不坚持海禁是个原则问题，是个“路线”问题。朝廷不肯开放海禁，王直等无奈只好死心塌地武装走私，抢劫夺掠，正式当起海盗。
这种事如果发生在当时的欧洲，王直遭遇到的肯定是另一种命运。欧洲英法西葡等国的君主遇到这种事，肯定喜出望外，会马上给他封官封侯，然后把这块领土并入自己帝国的版图内。想想看吧，假如现在日本九州长崎口子上的五岛群岛是中国的领土，那将是一个什么样的局面，恐怕中国近五百年的历史都得改写。
就以与嘉靖、万历同时期的英国伊利莎白一世女皇（1558-1603在位）为例。熟悉地理的人都知道在南美洲南端有个德雷克海峡，这是大西洋和太平洋之间的通道。但是这位海峡的冠名者德雷克，原来是个海盗。伊莉莎白一世不但不打压这些海盗，反而支持他、指使他去抢劫西班牙的船只和殖民地。然后支持他于1578-1580年完成从英国横渡大西洋、太平洋和印度洋回到英国，成为绕地球一圈的第一个英国人。船只到达伦敦后，女皇亲自登船慰问并授予他爵士头衔。德雷克没有辜负女皇的恩典，在1588年英国海军与西班牙无敌舰队的战斗中，他任英国舰队副司令，身先士卒，把无敌舰队打得落花流水。奠定了日后英帝国成为日不落帝国的基础。
为什么对同样都是海盗，中国和英国的差别就能差那么远呢？中国和西方的态度会截然相反。这里有个深层次的文化差异的因素。中国根深蒂固的大陆文化、重农主义，把任何海洋文化、重商主义思想扼杀殆尽，李烨当然不会让这种事情在自己手中发生。
虽然也有很多人，对于李烨热衷占领岛屿的做法很不理解，甚至认为李烨这是劳命伤财，把百姓运往如此遥远的岛屿上居住，以后应该如何管理都成问题。
但是很快李烨的做法就让这些人大跌眼镜，当年六岛十二寨投靠辽东半岛的时候，也有人劝说李烨，应该将六岛十二寨放弃，岛上的居民全部迁回辽东半岛。
结果，李烨做出了一个出人意料的举动，将长海县其中的两个岛屿拿出来拍卖，购买岛屿的人，可以在岛上修建城堡，岛上可以自备刀枪弓弩，而且李烨还附送他们四门火炮，美其名曰是防御贼人和海盗，并且官府无权管理岛上的事务，当然不包括反叛和谋杀罪，为此李烨还专门编订了一个岛屿使用条例，用来鼓励和约束购买岛屿的人。
此项条例一处，商贾和富户蜂涌前来购买长岛县的岛屿，两座不足一平方公里的岛屿，被出价一千缗的高价买走。
李烨的目的在于让所有人的目光从陆地转移到海洋上，为此李烨准备每年都拿出一些适合人居住的岛屿进行拍卖，而且还准备把一些岛屿作为奖赏，封赏给有功之臣，也让他们把目光投向大海的深处。
行政区域的划分显然在众人的意料之中，至于多出来的几个县，原本以前也是镇所，现在提升为县衙，并没有引起众人的反对，因为所有人的目光都被吸引到后面的官吏选拔上面。
由于，李烨在辽东半岛的管理早期，已经培养了大批的官吏，现在不过是进行重新权力划分而已，本着官吏能少则少的原则，除了州府有一套完整的行政机构外，让所有人大跌眼镜的是，很多县只有县令一个官员，剩下的全部是所谓的国家公务人员。